大殿位于整個遺址的中心處,底部設(shè)置大型夯土臺基,高出地表6米。臺基分兩次筑成。早期筑成的臺基周邊開挖有寬1.3-1.7米的基槽,基槽內(nèi)以石條砌護(hù),平面呈“凸”字形。后期在“凸”字形兩側(cè)增筑,使臺基兩側(cè)使西擴(kuò)展。早、晚兩期臺基的夯筑方法一致,皆是以一層土、一層碎磚瓦的方式分層夯筑。這種作法與南京明故宮遺址內(nèi)宮殿地基的夯筑方法完全相同。但是早期夾夯的材料為普通的青磚、青瓦;而后期用料為素?zé)牧鹆槠。而且后期加筑的臺基未開挖基槽。臺基分兩次建成的現(xiàn)象說明大殿在建造過程中曾經(jīng)有過設(shè)計調(diào)整。
此次清理了大殿北半部分(大殿南半部因現(xiàn)代建筑疊壓未能發(fā)掘)。大殿底部以素?zé)鹆槠瑝|基,并經(jīng)夯打;匪闹荛_挖寬約1.2米的基槽。殿內(nèi)目前共發(fā)現(xiàn)三排五行共15個柱坑,殘存兩種型號的石柱礎(chǔ),其中外柱柱礎(chǔ)邊長1.5、高0.75米;內(nèi)柱柱礎(chǔ)邊長2、高1.75米。根據(jù)已發(fā)掘部分按對稱原理測算,大殿面闊七間,進(jìn)深五間,南北長53.03、東西深36.3米。而我國古代等級最高的建筑——北京故宮太和殿的尺寸為:長63.93米、深37.17米。兩者比較可以看出,該殿僅比太和殿體量略小,充分體現(xiàn)了大報恩寺“準(zhǔn)宮闕規(guī)制”的特點(diǎn)。