1937年屬宣平縣錦鼓鄉(xiāng)、崇義鄉(xiāng)。

1938年屬宣平縣曳嶺區(qū)錦鼓鄉(xiāng)、崇義鄉(xiāng)。

1940年屬宣平縣錦鼓鄉(xiāng)、崇義鄉(xiāng)。

1949年5月解放，分屬柳城區(qū)錦鼓鄉(xiāng)、曳嶺區(qū)崇義鄉(xiāng)。

1950年4月屬宣平縣柳城區(qū)三港鄉(xiāng)、曳坑鄉(xiāng)。

1956年3月，全縣設3個區(qū)，屬柳城區(qū)的三港鄉(xiāng)、曳嶺區(qū)的崇義鄉(xiāng)。

1958年5月撤銷宣平縣并入武義縣，同年10月撤銷武義縣并入永康縣，屬永康縣上游人民公社三港、曳坑大隊。

1960年1月并入柳城公社，設三港、曳坑兩個管理區(qū)。

1961年10月恢復武義縣，屬柳城區(qū)三港公社。

1983年7月改稱三港鄉(xiāng)，延續(xù)至今。

2001年9月區(qū)劃調整后，轄三港、洪潭、黃西、周源、曳坑、毛弄、石浦、章灣、陳上弄、雙村、五福11個村委會。

2004年7月，撤銷毛弄、陳上弄、雙村3個村委會合設曳源村村委會。