東晉稱寧和里。

宋末形成集鎮(zhèn)。

康熙四年（1665）為"臺州海防分府"駐地。

清代分設(shè)寧�？h楊家莊、包家莊和任家莊。

民國時期改莊為鄉(xiāng)，分屬包家、楊家、和任邵鄉(xiāng)。

1912年廢亭旁縣丞署，建亭旁執(zhí)法分署。

1940年三門建縣后，分屬包家鄉(xiāng)、楊家鄉(xiāng)和任邵鄉(xiāng)。

解放后，建亭旁鄉(xiāng)，屬亭旁區(qū)。

1958年冬改為亭旁管理區(qū)，屬亭旁（區(qū)）公社。

1961年以亭旁管理區(qū)建制亭旁公社，改屬海游區(qū)。

1962年回屬亭旁區(qū)。

1968年12月29日成立亭旁公社革命委員會。

1981年7月改為亭旁公社管理委員會。

1983年改為亭旁鄉(xiāng)。

1985年10月改制為亭旁鎮(zhèn)，轄19村。

1992年撤邵家、南溪鄉(xiāng)、彭賴3鄉(xiāng)，合并成亭旁、中門、壩頭3鄉(xiāng)鎮(zhèn)，亭旁鎮(zhèn)轄42村。

2001年11月撤中門、壩頭2鄉(xiāng)并入亭旁鎮(zhèn)，轄106村。

2018年行政府規(guī)模調(diào)整，轄54個行政村。