清時屬宰清鄉(xiāng)。

1925年屬北港鎮(zhèn)四十四都。

后改屬北港區(qū)。

1941年設(shè)鳳臥鄉(xiāng)，隸水頭區(qū)。

1949年仍稱鳳臥鄉(xiāng)，隸北港區(qū)。

1950年劃出塔邊、馬跡二鄉(xiāng)。

1952年分鳳臥鄉(xiāng)為東山和鳳臥二鄉(xiāng)，隸水頭區(qū)。

1956年又并為鳳臥鄉(xiāng)，同時并入原析出的內(nèi)塘鄉(xiāng)和馬跡鄉(xiāng)。

1958年分出內(nèi)塘、馬跡后，為水頭公社鳳臥大隊（管理區(qū)）。

1961年為鳳臥公社。

1984年復(fù)為鳳臥鄉(xiāng)，隸水頭區(qū)。

1988年改稱鳳臥鎮(zhèn)。

1992年內(nèi)塘鄉(xiāng)并入鳳臥鎮(zhèn)。

2011年并入水頭鎮(zhèn)。

2016年恢復(fù)鳳臥鎮(zhèn)。