西漢初（前205）置充國(guó)縣，東漢初平四年(公元193年)析置南充國(guó)縣。

三國(guó)蜀漢改隸巴西郡。

南朝宋元嘉八年(公元431年)改名南國(guó)縣，屬北巴西郡。

南朝梁天監(jiān)二年(公元503年)改名南部縣，屬南部郡。

隋屬巴西郡。

唐、宋屬閬州。

元屬保寧府。

明洪武十年(公元1377年)省，十三年復(fù)置。

1914年屬嘉陵道。

1933-1935年為川陜革命根據(jù)地，中國(guó)工農(nóng)紅軍在縣境東置閬南縣蘇維埃政權(quán)。

紅軍北上后屬第十一行政督察區(qū)。

1950年屬南充專區(qū)，1968年屬南充地區(qū)。

1993年7月改屬南充市。