清,屬巴塘土司轄地。
清光緒三十四年(1908年),巴塘改土歸流、建立巴安縣后,其亞日貢村以下屬東路保正,紅日貢村以上屬中路保正。
民國三十四年(1945年),該鄉(xiāng)的東路保正屬東區(qū)中和鄉(xiāng);中路保正屬南區(qū)新民鄉(xiāng)。
解放后,于1958年成立亞日貢鄉(xiāng)人民政府,隸東區(qū)(后改為中咱去)人民政府管理。
1962年6月,改稱亞日貢鄉(xiāng)人民委員會。
1969年8月,成立亞日貢鄉(xiāng)革命委員會。
1974年7月,該鄉(xiāng)建立人民公社后,稱為亞日貢公社革命委員會。
1981年,改為亞日貢公社管理委員會。
1983年3月,更名為亞日貢鄉(xiāng)人民政府。