明、清屬壽陽西稱清平鄉(xiāng)、林六都,西一里。
清光緒年間(1875~1908年)設(shè)韓莊所、于家莊所、太安驛所、大北河所。
1918年改為區(qū)村制,屬西鄉(xiāng)三區(qū)。
抗日戰(zhàn)爭初,路北劃分為5個(gè)區(qū),屬三區(qū)(南燕竹一帶)、四區(qū)(太安驛一帶)管轄。
1949年10月,壽陽縣調(diào)整為10個(gè)區(qū),屬八區(qū),1950年屬四區(qū),1952年10月,區(qū)下設(shè)鄉(xiāng),設(shè)頡家河、太安驛、南燕竹、韓莊、于家莊、中莊、王強(qiáng)鋪7鄉(xiāng)。
1955年區(qū)制撤銷,小鄉(xiāng)劃為大鄉(xiāng),設(shè)南燕竹、趙巷頭、太安驛3鄉(xiāng)。
1958年10月,設(shè)立人民公社,1960年8個(gè)人民公社調(diào)整為12個(gè)人民公社,其中增設(shè)南燕竹人民公社,所在地為南燕竹村。
1984年改為南燕竹鎮(zhèn)。