解放前屬太原縣四區(qū),1948年解放后屬晉源縣,1949年屬太原第二專署,1951年4月,屬第六區(qū)下轄的一個自然村;1954年7月,第六區(qū)改制為晉源區(qū)。
1957年3月,撤銷晉源區(qū)成立郊區(qū)。
1960年6月,取消郊區(qū)級建制,建立市直轄的9個大公社,設(shè)立晉祠農(nóng)村人民公社,轄花塔生產(chǎn)大隊,1970年屬南郊區(qū)晉祠人民公社下轄的一個生產(chǎn)大隊,1984年撤銷晉祠人民公社設(shè)立晉祠鎮(zhèn),改制為花塔村村民委員會,1997年設(shè)晉源區(qū),花塔村村民委員會屬于晉源區(qū)晉祠鎮(zhèn),一直沿用至今。