清同治年間(1862—1874年),建鎮(zhèn)。
清光緒十八年(1892年),屬加陽里所轄。
民國初年為懷陽聯保駐地,后屬丹陽鄉(xiāng)所轄。
民國二十七年至民國三十四年(1938—1945年),為山西省政府即二戰(zhàn)區(qū)司令長官閻錫山西渡黃河后駐地,當時改秋林為“興旗鎮(zhèn)”,抗戰(zhàn)勝利后恢復原名。
民國三十五年(1946年),隸屬丹陽鄉(xiāng)。
民國三十七年(1948年)3月,隸屬丹陽區(qū)。
1951年,屬交里區(qū)。
1957年7月,設秋林鄉(xiāng)。
1960年2月,成立秋林公社。
1984年12月,復設鄉(xiāng)。
1998年8月,改設鎮(zhèn)。
2001年11月,撤銷鹿川鄉(xiāng)并入秋林鎮(zhèn)。