北洋軍閥政府時期（1912~1928）馬坡屬山東省濟寧市鄒縣，國民黨政府時期（1929～1949），馬坡屬山東省第一行政區(qū)鄒縣。

抗日戰(zhàn)爭及解放戰(zhàn)爭時期，1939年，鄒縣建立（屬中共鄒滕嶧工委領導，5月改屬蘇魯豫特區(qū)轄的湖邊專區(qū)）。

馬坡屬鄒西縣。

1941年1月，鄒西、滕西縣撤銷，改建為湖東縣（屬魯南行政第一專區(qū)）。

馬坡屬湖東縣。

1944年10月，撤銷湖東縣，改建為鳧山縣，馬坡屬鳧山縣，1956年3月，撤銷鳧山縣。

馬坡屬濟寧縣。

1958年成立馬坡人民公社，同年12月劃歸微山縣。

1966年1月，馬坡改建為區(qū)，轄7個區(qū)，1969年9月恢復馬坡公社，1984年4月建馬坡鄉(xiāng)。

2010年7月撤鄉(xiāng)設鎮(zhèn)。