該鎮(zhèn)民國時(shí)期為惠民縣第三區(qū)。
1955年9月全縣轄區(qū)地名統(tǒng)改稱謂,更名石廟區(qū)。
1956年12月石廟區(qū)分化為石廟、龐家、青陽店、于王四個(gè)鄉(xiāng)。
1958年2月區(qū)劃調(diào)整,石廟、龐家、青陽店、于王四個(gè)鄉(xiāng)又合并為石廟鄉(xiāng)。
1958年11月建立人民公社時(shí),更名為石廟公社。
1961年石廟公社更名石廟區(qū),下轄于家寨、青陽店、孟家等7個(gè)公社。
1969年9月全縣撤區(qū)改社,復(fù)名石廟公社。
1971年析其東部地區(qū)置梁家公社。
1984年全縣撤銷人民公社建鄉(xiāng)鎮(zhèn),石廟公社更名石廟鄉(xiāng),梁家公社更名梁家鄉(xiāng)。
1985年石廟鄉(xiāng)更名石廟鎮(zhèn)。
2001年3月撤銷梁家鄉(xiāng),其行政區(qū)域劃入石廟鎮(zhèn)。