1951年，屬第三行政區(qū)，為巴溝鄉(xiāng)和卡力崗鄉(xiāng)。

1953年，由同德藏族自治區(qū)改為同德縣以后，巴溝為當時同德下設6區(qū)中的一區(qū)。

1956年10月至1957年底，重編為第五區(qū)（巴溝）。

1958年3月，撤區(qū)并鄉(xiāng)時巴溝、卡力崗合并為巴溝鄉(xiāng)，同年10月，改巴溝鄉(xiāng)公社。

1963年，分為松多、巴溝、卡力崗3個農業(yè)公社。

1965年，將原有的卡力崗公社、松多公社、巴溝公社合并為巴溝鄉(xiāng)。

1970年，改為巴溝人民公社。

1984年4月，復為巴溝鄉(xiāng)。