光緒二十一年（1895年），慈禧以年久失修為由，對剛建成16年的菩陀峪定東陵進行了重修。重修工程由慶親王弈劻和文淵閣大學士榮祿主持。隆恩殿、東西配殿、方城、明樓均拆除重建，并對其余建筑揭瓦大修，歷時13年，至慈禧臨死前幾天才全工告竣。重修后的慈禧陵，特別是隆恩殿和東西配殿構件改用名貴的黃花梨木、油飾彩繪全部貼金等在明清兩代皇陵中獨一無二，更顯精美豪華，金碧輝煌。