1950年建立城關(guān)（廂）鄉(xiāng)人民政府。

后改名為城關(guān)鎮(zhèn)。

1982年全國地名普查，因有云溪河流經(jīng)鎮(zhèn)境，又有杜甫著名的“云溪花淡淡，春廓水冷泠”的詩句而定名為“云溪鎮(zhèn)”。

1951年12月16日，城關(guān)鎮(zhèn)人民政府于東街華華巷內(nèi)（今云溪派出所），屬城關(guān)區(qū)人民政府領(lǐng)導(dǎo)。

轄東街、南街、北街三個居民委員會和一個城關(guān)村。

共34個居民小組，868戶，3514人。

其中農(nóng)業(yè)戶109戶，422人。

1956年5月20日，改城關(guān)鎮(zhèn)人民政府為城關(guān)鎮(zhèn)人民委員會，仍管轄原來的地區(qū)。

人口增加到881戶，6566人。

1961年，城關(guān)鎮(zhèn)人民委員會遷至新西街鹽工診所，同年又再次遷至東門的吳家祠（原敬老院）。

為縣人委直屬機關(guān)。

所轄城關(guān)村改名為城郊大隊（又名蔬菜大隊）。

1968年4月7日，成立城關(guān)鎮(zhèn)革命委員會。

1981年3月，復(fù)稱城關(guān)鎮(zhèn)人民政府，所轄各街道恢復(fù)居民委員會，城郊大隊改名為城郊村。

1982年3月，改名為云溪鎮(zhèn)后，所轄地區(qū)由原來的三個居民委員會擴大為東街、南街、北街、新西街、鳳池街五個居民委員會和一個城郊村。

共有2970戶，13644人，其中農(nóng)業(yè)人口572人。

1992年10月撤區(qū)并鄉(xiāng)建鎮(zhèn)，撤銷原鳳靈區(qū)公所，新設(shè)云溪鎮(zhèn)，將原龍江鄉(xiāng)、七寶鄉(xiāng)、臨江鄉(xiāng)、新農(nóng)鄉(xiāng)整鄉(xiāng)和原堠溪鄉(xiāng)的指南村并入，共有7個居民委員會，28個村民委員會，新設(shè)城東社區(qū)和梓江社區(qū)(原鹽亭絲廠片區(qū))。

1995年1月，建置調(diào)整，新農(nóng)鄉(xiāng)撤出單列，云溪鎮(zhèn)管轄原城區(qū)、龍江、七寶、臨江鄉(xiāng)和指南村。

2003年12月設(shè)文同社區(qū)；2004年8月城郊村改村設(shè)居，稱彌江社區(qū)；2006年指南村改村為居委會。

2008年月園村劃歸縣工業(yè)園區(qū)。

2011年臨江村劃歸縣工業(yè)園區(qū)。

2013年底云溪鎮(zhèn)共有13個社區(qū)居民委員會(紅光、石龍、石嶺屬村改居)、14個行政村。

社區(qū)是東街、南街、北街、新西街、鳳池、文同、彌江、城東路、指南、梓江、紅光、石嶺、石龍。

行政村是先鋒、河溪、咸水、萬安、三義、復(fù)興、石牌、三清、陽山、海門、昝家、大埝、東一、石坎。

2014年底經(jīng)縣政府批準(zhǔn)云溪鎮(zhèn)又新設(shè)立云盤、濱江兩個社區(qū)。

2017年2月，鹽亭縣撤銷新農(nóng)鄉(xiāng)，將其所屬行政區(qū)域劃歸云溪鎮(zhèn)管轄，云溪鎮(zhèn)人民政府駐鳳池街8號。