民國(guó)元年(1912年),北井子區(qū)隸屬鳳城縣第三區(qū)。
民國(guó)二十二年(1933年),北井子區(qū)隸屬安東縣。
民國(guó)三十四年(1945年)9月中旬,北井子為安東縣第七區(qū)。
民國(guó)三十六年(1947年)6月,成立安東縣北井子區(qū)工委和區(qū)公所。
1951年5月,與長(zhǎng)山區(qū)合并。
1958年5月,撤區(qū)并鄉(xiāng)設(shè)北井子鄉(xiāng);同年9月,把東尖山轄區(qū)內(nèi)的下崗、富家、山北3個(gè)村劃歸北井子,同時(shí)成立北井子公社。
1961年7月16日,長(zhǎng)山、柞木、椅圈作業(yè)區(qū)從北井子公社劃出。
1961年7月4日,孤山鄉(xiāng)管轄的獐島劃歸北井子公社。
1983年8月8日,建立北井子鄉(xiāng)。
1985年3月5日,撤鄉(xiāng)建立北井子鎮(zhèn)。