清道光二十三年(1843年),金州廳在長山列島設(shè)置島區(qū)(即金州16島)。
清光緒三十一年(1905年),日俄戰(zhàn)爭以后,淪為日本殖民地。
民國三十四年(1945年)11月,解放,建立鄉(xiāng)(區(qū))人民政權(quán),先后屬新金縣、金縣、長海(長山)縣。
1950年8月,獐子區(qū)為長山縣第四區(qū)。
1955年6月,第四區(qū)改稱獐子區(qū)。
1956年3月,獐子區(qū)改為獐子大耗、小耗、搭槌4鄉(xiāng),直屬旅大市長?h。
1958年6月,4鄉(xiāng)合并為獐子鄉(xiāng)。
同年10月,建獐子公社。
1983年9月,撤社建鄉(xiāng),為獐子鄉(xiāng)。
1985年5月,撤鄉(xiāng)建鎮(zhèn),隸屬未變。
2009年10月,獐子鎮(zhèn)改稱獐子島鎮(zhèn)。