圣方濟各教堂是圣馬力諾最古老、最富藝術性的建筑,位于首都圣方濟各門右側(cè),建于14世紀,這座小教堂的建筑形式類似澳門一般教堂的巴羅克式建筑。教堂的外墻為白色,橢圓形窗戶及一座鐘樓,教堂前有一座紀念碑,以紀念當?shù)?910年戰(zhàn)勝海盜一役。教堂正門上方懸一石匾,刻有公元1361年1月動工興建等字樣和一只頭戴王冠、展翅欲飛的雄鷹浮雕,其旁還有一戴冕頭像的浮雕。
教堂的主祭臺上,有十分珍貴的14世紀木刻耶穌像和建于1405年小巧而精美的古鐘樓。在帶有拱頂?shù)幕乩壬嫌?4、15世紀的儀仗十字架,13世紀的圣骨匣及其他宗教器物、墓碑、壁畫和各個時期的繪畫。圣方濟各教堂還曾是圣馬力諾學社的舊址,培育出過一批知名的神職人員,如今它又成為圣馬力諾的旅游勝地,吸引著世界各地的游客。