云巖禪寺始建于唐朝德宗貞元二年(即公元786年),開山祖師曇晟是有名望的高僧。五代時期該寺毀于戰(zhàn)亂,至宋代建立漸次修復(fù),并與黃龍禪院等六座禪院并稱修水六大禪院,明代嘉靖年間州同林春澤曾為云巖禪院題匾額“修江第一禪林”。