1949年前屬姚畈區(qū)大橋鄉(xiāng)。
1950年分屬曹溪、東港、邵畈、橫橋、劉家、洪家、馬山等鄉(xiāng);1956年為曹溪鄉(xiāng),1958年成立曹溪人民公社;1961年分設為曹溪、邵畈、姚畈三個公社;1968年邵畈并入曹溪公社,姚畈公社分別并入曹溪公社和三縣嶺墾殖場。
1980年曹溪大隊的店上、益壩、門上三個自然村劃歸三縣嶺墾殖場。
1984年改為曹溪鄉(xiāng);1992年7月撤銷曹溪鄉(xiāng)設立曹溪鎮(zhèn);2006年1月撤銷三縣嶺鄉(xiāng)整建制劃歸曹溪鎮(zhèn);2016年9月將曹溪鎮(zhèn)的姚畈、陳屋2個居委會和龍家、沙灣、程橋、徐門、店上、前畈、瑤上、浪灣、港王等9個村委會整建制劃入新設立的三縣嶺鎮(zhèn)。