明清時屬明賢鄉(xiāng)。
1949年屬六區(qū)桐源鄉(xiāng)。
中華人民共和國成立后隸屬第八區(qū)。
1956年撤區(qū)并鄉(xiāng)。
毛坊鄉(xiāng)、恩坊鄉(xiāng)并入東坊鄉(xiāng);圳口鄉(xiāng)、西田半個鄉(xiāng)并入桐源鄉(xiāng);西滸鄉(xiāng)、同樂鄉(xiāng)并入石橋鄉(xiāng)。
合作化時,有赤山、黨溪、塘東、高洲、池溪、高家、大田、嶺西、圳口、恩坊、黃源、杜溪、毛坑、缺坊、東坊、水源、桐源、黃溪、青坑等19個高級社。
1958年成立桐源公社,分為19個大隊。
1962年析置桐源,東坊公社。
1968年又合成桐源公社。
1984年5月更名為桐源鄉(xiāng)。
2000年6月23日,國務院(國函字[2000]83號),撤銷撫州地區(qū)和縣級臨川市,設立地級撫州市。
撫州市設立臨川區(qū),桐源鄉(xiāng)屬臨川區(qū)。
命名沿用至今。