明清時期，干洲片屬從善鄉(xiāng)，崗前片屬建康鄉(xiāng)。

1929年，建康鄉(xiāng)屬一區(qū)三溪聯(lián)保，從善鄉(xiāng)屬一區(qū)干洲聯(lián)保。

1932年，建康鄉(xiāng)改屬一區(qū)六分鄉(xiāng)（后改界竹鄉(xiāng)），從善鄉(xiāng)改屬六區(qū)干洲鄉(xiāng)。

1935年，干洲鄉(xiāng)屬一區(qū)，界竹鄉(xiāng)未變。

1945年，界竹、六分、干洲被分別設(shè)鄉(xiāng)。

1946年，六分鄉(xiāng)并入界竹鄉(xiāng)，干洲未變。

1949年建康鄉(xiāng)屬三區(qū)界竹鄉(xiāng)，從善鄉(xiāng)屬三區(qū)干洲鎮(zhèn)。

1956年，界竹鄉(xiāng)被拆分為屬赤岸區(qū)的赤墎鄉(xiāng)和三溪鄉(xiāng)，干洲鎮(zhèn)仍屬赤岸區(qū)。

1957年，赤墎鄉(xiāng)和三溪鄉(xiāng)合并為崗前鄉(xiāng)，干洲鎮(zhèn)改稱干洲鄉(xiāng)。

1958年，崗前、干洲兩鄉(xiāng)合并為干洲人民公社。

1961年又拆分為崗前和干洲兩個人民公社。

1968年合并為干洲人民公社。

1983年冬，干洲人民公社改稱干洲鄉(xiāng)。

1986年4月干洲鄉(xiāng)改稱干洲鎮(zhèn)。