明清時(shí)屬散毛土司管轄。

清乾隆元年（1736），來鳳建縣后屬體乾鄉(xiāng)貞肅里。

民國(guó)時(shí)期，先后屬一區(qū)、貞肅鄉(xiāng)、三胡鄉(xiāng)。

1950年，改保甲制為村、組，成立三胡區(qū)。

1952年，區(qū)村行政區(qū)劃調(diào)整，村易名為鄉(xiāng)，三胡區(qū)轄22鄉(xiāng)，苗寨溝屬猴栗鄉(xiāng)。

1958年成立人民公社，政社合一，屬苗中大隊(duì)。

1961年，恢復(fù)區(qū)制，屬苗中大隊(duì)。

1975年，撤區(qū)并社時(shí)仍屬苗中大隊(duì)。

1984年6月設(shè)區(qū)建鄉(xiāng)苗中大隊(duì)一分為二，成立苗寨溝村和猴栗堡村，苗寨溝村民委員會(huì)成立，至2015年村名不變。