1952年至1959年，屬民主鄉(xiāng)；1959年至1964年，為民主大隊(duì)；1964年至1967年，更名為花山吳大隊(duì)；1967年，恢復(fù)原名民主大隊(duì)；1980年，第一次地名普查更大隊(duì)名為花山吳大隊(duì)，屬五里界公社；1983年，改名為花山吳村，屬五里界鄉(xiāng)。

1987年，屬五里界鎮(zhèn)；2006年1月，花山吳村托管至武漢江夏經(jīng)濟(jì)開(kāi)發(fā)區(qū)廟山辦事處至今。

花山吳村原有自然村18個(gè)，2012年征地拆遷，將6個(gè)自然村拆遷，現(xiàn)余下12個(gè)自然村。