明清屬唐縣長秋保(今長秋村)。
1914年屬沘源縣。
1923年屬唐河縣城關(guān)區(qū)。
1931年屬張店區(qū)。
1941年屬城關(guān)區(qū)上屯聯(lián)保。
1945年撤區(qū)屬長秋鎮(zhèn)。
1948年屬唐西縣第二區(qū)(駐長秋)。
1949年屬唐河縣第八區(qū)(駐郭灘)。
1951年屬叟劉區(qū)。
1953年為郭灘區(qū)。
1956年撤區(qū),屬長秋中心鄉(xiāng)。
1958年建馬屯大隊,屬上屯人民公社。
1961年屬上屯區(qū)長秋人民公社。
1968年撤區(qū),屬上屯人民公社。
1983年改為上屯鄉(xiāng)馬屯村民委員會。
1999年撤鄉(xiāng)建鎮(zhèn),屬上屯鎮(zhèn)。