清光緒二十七年(1901),有尹乃廷、單玉奇5戶墾民來此合買官地九“井”(每井為36方)墾殖立屯,取名“五福堂”。
翌年,因“五!迸c“無福”諧音,故改名“九井屯”。
中華民國(guó)時(shí)期,隸屬訥河縣第二區(qū)管轄。
東北淪陷后,初隸訥南鎮(zhèn)區(qū),1938年1月改設(shè)九井村。
1945年“九三”抗日戰(zhàn)爭(zhēng)勝利后,隸屬訥南區(qū),后改隸第六區(qū)管轄。
1949年9月,從第六區(qū)劃出增設(shè)第十三區(qū),1955年5月改為九井區(qū)。
1956年4月,撤區(qū)劃鄉(xiāng),分設(shè)九井、謙益、育民3個(gè)鄉(xiāng)。
1958年9月,將3個(gè)鄉(xiāng)合并成立運(yùn)河人民公社,翌年3月改稱九井公社。
1984年4月,改為九井鄉(xiāng)。
1996年9月,改為九井鎮(zhèn)。
名稱沿用至今。