明代屬新貴縣，清康熙三十四年（1695）廢新貴縣入貴筑縣。

1931年隸貴陽第一區(qū)，其地分置小碧、水壩、甘莊、黃泥、秦棋、大地等6個鄉(xiāng)。

1941年廢貴陽縣諸鄉(xiāng)合并，隸貴筑縣直轄鄉(xiāng)文萃鄉(xiāng)。

1953年屬貴筑縣第十區(qū)，其地復置小碧、貓洞二鄉(xiāng)，1954年劃入貴陽市郊區(qū)，1958年置孟關人民公社，以小碧、貓洞二鄉(xiāng)置小碧管理區(qū)，1963年小碧管理區(qū)從孟關公社分出置小碧人民公社，公社管理委員會駐小碧寨，同年7月管理委員會駐貓洞場。

其時，公社轄貓洞、大地、馬寨、秦棋、小碧、水壩、營盤、甘莊、下壩、二堡、黃泥堡、黃泥哨等12個生產(chǎn)大隊，111個生產(chǎn)隊，33個自然村。

1984年11月廢小碧人民公社，建小碧布依族苗族鄉(xiāng)。

原12個生產(chǎn)大隊改為12個村民委員會，57個村民組，34個自然村。

2009年1月16日成建制劃入南明區(qū)，2015年5月，小碧布依族苗族鄉(xiāng)劃轉(zhuǎn)貴州雙龍航空港經(jīng)濟區(qū)托管。