元、明、清屬鎮(zhèn)遠(yuǎn)府轄。
1941年,王家屯、狗牙由石阡縣撥給江口縣。
1950年3月,江口縣人民政府成立,隸屬三區(qū)。
1958年10月,全縣公社化后,屬前進(jìn)人民公社,建軍屯大隊(duì)。
1984年4月,軍屯大隊(duì)更名為軍屯村,屬洪坪鄉(xiāng)。
1991年8月“建并撤”,民和鄉(xiāng)、洪坪鄉(xiāng)、鐵廠鄉(xiāng)、凱里鄉(xiāng)合并,屬民和侗族土家族苗族鄉(xiāng)。
2005年2月,全縣推進(jìn)“撤小村并大村”工作,軍屯村、木碩村并入洪坪村。
2013年,大村分小村后為軍屯村。
2013年6月,屬民和鎮(zhèn)。