歷史上,先后隸屬于南?し淼兀ㄇ兀、博羅縣(漢三國)、寶安縣(東晉咸和6年至唐至德二年),東莞縣(送開寶五年,東莞縣并入曾城先,本村屬增城先,宋開寶六年1937年復(fù)置東莞縣至明碗歷元年)、新安縣(萬歷元年1573年,析東莞縣,置新安縣,明萬歷元年至清康熙五年)、東莞縣(清康熙五年至清末),寶安縣(民國3年、1914年至中華人民共和國成立前)。
1949年10月至1951年屬惠陽縣第四區(qū):1951年11月至1957年11月屬惠陽縣第七區(qū);1957年12月至1958年3月屬惠陽大鵬鄉(xiāng);1958年3月至1958年11月屬惠陽大鵬公社;1958年11月至1983年7月屬寶安縣大鵬公社;1983年7月至1986年10月屬寶安縣大鵬區(qū);1986年10月至1993年一月屬寶安縣南澳鎮(zhèn);1993年1月至今屬深圳市龍崗區(qū)南澳街道。
2004年9月,東山村民委員會(huì)改為東山社區(qū)居委會(huì),名稱沿用至今。