明永樂年間（1403~1424年），睦崗街道境域屬桂林都桂林圩。

民國二十九年（1940年），屬西屯鄉(xiāng)。

民國三十二年（1943年），西屯鄉(xiāng)與小湘鄉(xiāng)合并為桂湘鄉(xiāng)。

1950年，桂湘鄉(xiāng)與北桂鄉(xiāng)合并為二桂鄉(xiāng)，劃歸高要縣。

1958年9月，二桂鄉(xiāng)與雙東鄉(xiāng)（現(xiàn)黃崗街道范圍）合并為肇慶市郊區(qū)公社。

1974年1月，肇慶市郊區(qū)公社撤消分為睦崗和下黃崗2公社。

1983年8月，睦崗公社改為肇慶市睦崗區(qū)。

1987年，改為睦崗鎮(zhèn)。

2010年10月，改為端州區(qū)睦崗街道。