民國十八年(1929年),屬玉門縣第區(qū)。
民國三十二年(1943年),屬靖邊鄉(xiāng)。
民國三十八年(1949年),設(shè)靖邊區(qū),轄10鄉(xiāng)。
1953年,將靖邊區(qū)分設(shè)靖西、靖東2區(qū),靖西區(qū)轄川北鎮(zhèn)、南陽鎮(zhèn)、芨芨臺子、黃閘灣、西黃花營、東黃花營6鄉(xiāng)。
1955年,撤區(qū)并鄉(xiāng),設(shè)南陽鎮(zhèn)、黃閘灣(包括西黃花營)黃花營3鄉(xiāng)。
1958年,成立衛(wèi)星公社,后屬玉門鎮(zhèn)公社靖西管理區(qū)。
1961年5月,設(shè)立黃閘灣公社增設(shè)北湖村。
1983年3月,改為黃閘灣鄉(xiāng)。
2016年1月,根據(jù)《甘肅省民政廳關(guān)于酒泉市肅州區(qū)泉湖鄉(xiāng)等8個鄉(xiāng)鎮(zhèn)撤鄉(xiāng)改鎮(zhèn)的批復(fù)》(甘民復(fù)〔2015〕50號),黃閘灣鄉(xiāng)撤鄉(xiāng)改鎮(zhèn),改為黃閘灣鎮(zhèn)。
2016年5月,正式撤鄉(xiāng)改鎮(zhèn)掛牌。