1949年文縣解放，1951年全縣調整為6區(qū)46鄉(xiāng)，屬興文區(qū)舊寨鄉(xiāng)轄。

1953年6月全縣調整為9區(qū)70鄉(xiāng)，仍屬興文區(qū)舊寨鄉(xiāng)轄。

1955年10月合并區(qū)、鄉(xiāng)機構，舊寨鄉(xiāng)并入鐵樓鄉(xiāng)，今石門溝村隨之并入，屬興文區(qū)鐵樓鄉(xiāng)轄。

1958年12月成立城關公社，為城關公社石門溝大隊。

1961年公社劃小，為鐵樓公社石門溝大隊。

1981年鐵樓公社改為鐵樓藏族公社，屬鐵樓藏族公社轄。

1983年10月鐵樓藏族公社改為鐵樓藏族鄉(xiāng)，屬鐵樓藏族鄉(xiāng)轄。

1984年4月石門溝大隊改為石門溝村，村下建合作社。

1986年設立石門溝村村民委員會，所屬合作社改稱村民小組。