其前身為楊家堡村和水庫村。

楊家堡村1950年建政，屬四區(qū)五鄉(xiāng)三行政。

1955年建紅光初級社。

1956年并入水庫高級社。

1958年為敦煌人民公社河西大隊水庫生產隊。

1961年建楊家堡大隊。

1966年更名為紅衛(wèi)公社立新大隊。

1969年恢復原名。

1983年3月改置村。

水庫村有3個村民小組。

清雍正年間，水庫村從甘肅省河州（清代河州屬蘭州府，與當時的狄道州并列。

河州當時的管轄范圍為現(xiàn)在我省的東鄉(xiāng)撤拉族回族自治縣、和政縣、夏河縣、臨夏市、永靖縣及青海省的循化撒拉族自治縣。

（注：河州存在時，上述地方并沒設縣治）遷入移民，建新河州坊。

孟家橋鄉(xiāng)與肅州鎮(zhèn)接壤處曾有一湖，地處戈壁，四面環(huán)沙，為地下泉水匯集而成。

雖湖面寬廣，于民溉田水量卻很有限。

1949年后，縣上組織人員在湖內修建兩座水壩，積蓄湖水灌溉笆子場以及下游的大片良田，一個簡易的蓄水庫就這樣形成了。

雖然水量不大，但它是敦煌縣修建最早的蓄水庫，后來，人們稱此地為水庫村。

水庫村1950年建政時為四區(qū)五鄉(xiāng)四行政。

1955年和11、12、13行政村組成水庫初級社。

1957年和楊家堡并為高級五社。

1958年為敦煌人民公社河西大隊第八中隊。

1961年建水庫大隊。

1983年3月改置村。

2007年1月省入楊家堡村。