歷史唐代，該鎮(zhèn)分屬于閩縣雙桂鄉(xiāng)、鳳池鄉(xiāng)、靈芝鄉(xiāng)。

宋、元、明、清各代分鼓山鎮(zhèn)，屬閩縣鳳池西鄉(xiāng)、鳳池東鄉(xiāng)和晉安西鄉(xiāng)。

清末分屬閩縣東三區(qū)（東山區(qū)）的歸善里、瑞圣里、雙溪里和鼓山里。

民國時屬閩侯（林森）縣二區(qū)（閩安鎮(zhèn)區(qū)）的松鼓鄉(xiāng)（前期為松亭鄉(xiāng)、鼓麓鄉(xiāng)）和雙岳鄉(xiāng)（前期為雙峰鄉(xiāng)、岳峰鄉(xiāng)）。

1949年12月，劃歸福州市管轄，設(shè)立鼓山區(qū)。

1955年5月鼓山區(qū)被撤銷后，原所轄各鄉(xiāng)先后由郊區(qū)行政辦事處和福州市人民委員會直接領(lǐng)導。

1958年成立鼓山人民公社（1959年7月之前，稱為福州市郊人民公社鼓山分社）。

1960年3月，復置鼓山區(qū)。

1969年11月，鼓山區(qū)改稱鼓山人民公社。

1970年2月，鼓山公社并入赤衛(wèi)（臺江）公社，劃歸赤衛(wèi)（臺江）區(qū)。

1973年10月，從赤衛(wèi)公社析出，又與東風（鼓嶺）公社合并為新的東風公社。

1975年3月，原東風（鼓嶺）公社劃出后，又恢復鼓山公社。

同年5月，劃歸郊區(qū)。

1984年9月撤社建鄉(xiāng)，1992年9月撤鄉(xiāng)建鎮(zhèn)。

1996年，郊區(qū)改稱晉安區(qū)，鼓山鎮(zhèn)屬晉安區(qū)。