兩河村在新中國成立前，屬天橋鄉(xiāng)第10保、11保的一部分。

新中國成立后，現(xiàn)兩河村大坪部分屬農(nóng)林小鄉(xiāng)，兩河部分屬廟壩小鄉(xiāng)。

1957年，建農(nóng)業(yè)高級社時，由大坪部分與廟壩村的兩河口部分，大壩村的新橋部分合并建立兩河高級社。

1962年，分為兩河大隊(duì)、大坪大隊(duì)。

1984年5月，分別改稱為兩河村、大坪村，隸屬兩河鄉(xiāng)。

1984年9月，兩河鄉(xiāng)更名為南天鄉(xiāng)，隸屬南天鄉(xiāng)。

2001年12月，撤鄉(xiāng)建鎮(zhèn)，設(shè)立石林鎮(zhèn)，隸屬石林鎮(zhèn)。

2004年9月，村組建制調(diào)整時，大坪村、兩河村合并稱兩河村。