該村解放前為思居鄉(xiāng)二保,1950年為二村,1953年從思居鄉(xiāng)分出,為大巖鄉(xiāng)雙河村,1955年為新生初級社,1956年思居大巖合并,1958年為思居五管理區(qū),1962年又從思居分出為大巖公社為五大隊,1972年為雙河大隊,1981年更名為金廟大隊,1998年改為村。
2009年由原金廟村1.2.3.4.5.6.7.8組和馬道村的9.8.7.6.5.4.3.2.1組合并為金馬村,2010年10月由金廟村和馬道村合并,為現(xiàn)在的金馬村。
得名沿用至今。