金天德三年（1151），于潞縣治設(shè)州，取“漕運通濟”之意稱通州，潞縣屬之。

元升漷陰縣為州稱漷州。

明洪武十三年（1380），漷州降為縣，稱漷縣。

1914年改州為縣，始稱通縣。

1948年底，通縣全境解放，隸屬通縣專區(qū)。

1958年3月7日國務(wù)院批準，將河北省通縣劃歸北京市。

1958年5月29日國務(wù)院批準，撤銷通縣和通州市，合并成立通州區(qū)。

1960年1月7日國務(wù)院批準，撤銷通州區(qū)，恢復(fù)通縣。

1997年4月29日，《國務(wù)院關(guān)于同意北京市撤銷通縣設(shè)立通州區(qū)的批復(fù)》國函〔1997〕30號，撤銷通縣，設(shè)立通州區(qū)。

2020年下轄17個街道鄉(xiāng)鎮(zhèn)。

2022年，下轄11個街道辦事處，11個鄉(xiāng)鎮(zhèn)。