1934年設(shè)保，起垅村的大部分村民屬馬橋保；1950年改屬馬橋行政村；1952年4月改名起垅村，屬馬橋鄉(xiāng)；1956年4月跳頭、馬東等生產(chǎn)隊(duì)屬馬橋高級(jí)農(nóng)業(yè)社；1958年10月，屬于大公圩公社馬橋大隊(duì)；1962年3月改名為起垅大隊(duì)，劃屬石橋人民公社；1969年3月，起垅、石橋兩公社合并為石橋人民公社起垅大隊(duì)，屬起垅公社管轄。

1984年體改，廢公社、大隊(duì)體制，成立鄉(xiāng)、行政村組織，原起垅大隊(duì)改為起垅行政村，屬石橋人民政府。

2005年10月，起垅村和新建村合并為起垅村村民委員會(huì)，屬石橋鎮(zhèn)人民政府。